محل کار مهندس کشتی، بسته به نوع کشتی و مسئولیتِ او متفاوت است. بااین‌حال، می‌توان گفت مهندسین کشتی، عمده‌ی زمانِ خود را در دریا و در اتاقک‌های کنترل می‌گذرانند. بخشِ مهندسی در هر کشتی، مرکزی برای نظارت و تعمیراتِ مداومِ کشتی است که مهندسین کشتی در آن مستقر می‌شوند و عملیات‌های نگهداری و تعمیرات را از آنجا هدایت می‌کنند. از آنجا که بخشِ عمده‌ای از زمان کاری مهندسین کشتی در دریا و یا بنادرِ مختلف می‌گذرد، آن‌ها باید انعطاف‌پذیری و سازگاری بالایی با شرایط آب و هواییِ مختلف داشته باشند و بتوانند زمانِ طولانی‌ای را از خانواده‌های خود دور بمانند.